O MBA é composto, por ordem arbitrária, pelo módulo de três meses Management for Aeronautics e por uma das pós-graduações que o ISEC tem vindo a desenvolver em parceria: Operações de Transporte Aéreo, Gestão Aeroportuária e Flight Operations Management. O Módulo é em colaboração com o Centro de Estudos de
Gestão (CEGE) do Departamento de Gestão do ISEG (Instituto Superior de Economia e Gestão da Universidade
Técnica de Lisboa) . É leccionado por professores do ISEG e por executivos do sector da aviação comercial.